RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-208ENST00000578446 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 CYP11B2P19099 503 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 HOXC8P31273 242 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 AFMP43652 599 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 PTGISQ16647 500 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 KANK3Q6NY19 840 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 STAMQ92783 540 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 MTRQ99707 1265 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 TREHO43280 583 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 CYP2C9P11712 490 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 GUCY2CP25092 1073 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 TMOD1P28289 359 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 DNM2P50570 870 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 CLCN3P51790 818 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 ASIC1P78348 528 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 HIC1Q14526 733 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 TRIM60Q495X7 471 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 TAF2Q6P1X5 1199 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 DYMQ7RTS9 669 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 GPT2Q8TD30 523 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 DDX12PQ92771 950 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 PAGE5Q96GU1 130 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 DRC1Q96MC2 740 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 TIGD1Q96MW7 591 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 CEP89Q96ST8 783 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 MAP7D2Q96T17 732 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 REEP2Q9BRK0 252 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 TIPINQ9BVW5 301 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.84□□□□□ -0.51
USP22-208ENST00000578446 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 MYMKA6NI61 221 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 DCDC2CA8MYV0 355 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 B4GALT4O60513 344 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 HIP1RO75146 1068 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 CDK7P50613 346 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 RTP1P59025 263 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 ADAM17P78536 824 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 SNX17Q15036 470 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 POSTNQ15063 836 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 NFKBIBQ15653 356 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 RUFY4Q6ZNE9 571 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 RSPH3Q86UC2 560 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 SERINC5Q86VE9 423 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 TCP11Q8WWU5 503 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 KIFAP3Q92845 792 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 TMEM143Q96AN5 459 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 SCLT1Q96NL6 688 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 TRIM9Q9C026 710 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 NUP62CLQ9H1M0 184 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 AKT3Q9Y243 479 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.83□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 FAM13AO94988 1023 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 MYL1P05976 194 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 IDEP14735 1019 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 TLE2Q04725 743 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 PTK7Q13308 1070 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 DRP2Q13474 957 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 CAMK4Q16566 473 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 ARSHQ5FYA8 562 aa11.82□□□□□ -0.52
USP22-208ENST00000578446 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms