RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 MAFGO15525 162 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPNS3-204ENST00000575194 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPNS3-204ENST00000575194 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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SPNS3-204ENST00000575194 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
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SPNS3-204ENST00000575194 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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SPNS3-204ENST00000575194 MYBPC2Q14324 1141 aa20.5■□□□□ 0.87
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SPNS3-204ENST00000575194 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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SPNS3-204ENST00000575194 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS3-204ENST00000575194 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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