RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CCSER1Q9C0I3 900 aa36.93■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUGCTQ9HAC7 445 aa36.93■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSPH10B2B2RC85 870 aa36.92■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSPH10BP0C881 870 aa36.92■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSF2RAP15509 400 aa36.92■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPECC1Q5M775 1068 aa36.92■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAF7Q6Q0C0 670 aa36.92■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC71Q8N4P6 559 aa36.92■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 CALML4Q96GE6 196 aa36.92■■■■□ 3.5
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CHAMP1Q96JM3 812 aa36.91■■■■□ 3.5
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RFC2P35250 354 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRB10Q13322 594 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM26DQ5JW98 314 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 IER5Q5VY09 327 aa36.9■■■■□ 3.5
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EPSTI1Q96J88 318 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP7D2Q96T17 732 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 GDF15Q99988 308 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHMP5Q9NZZ3 219 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCN5AQ14524 2016 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAS2O43903 313 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 CUTAO60888 179 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXLNAP40222 546 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNM2P50570 870 aa36.9■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP36.9■■■■□ 3.52e-6■■■□□ 18
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CTDNEP1-209ENST00000574205 M0QZ92 97 aa36.89■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 ME1P48163 572 aa36.89■■■■□ 3.5
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM119Q4V9L6 283 aa36.89■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP49Q70CQ1 688 aa36.89■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASSF8Q8NHQ8 419 aa36.89■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 BHMT2Q9H2M3 363 aa36.89■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKT3Q9Y243 479 aa36.89■■■■□ 3.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 E9PMD0 336 aa36.88■■■■□ 3.49
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MTRQ99707 1265 aa36.88■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF35A5YM69 484 aa36.87■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 EYA4O95677 639 aa36.87■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNA1P02708 482 aa36.87■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 KARSQ15046 597 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNK18Q7Z418 384 aa36.87■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF710Q8N1W2 664 aa36.87■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLIN2Q99541 437 aa36.87■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa36.87■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHA7Q9UN72 937 aa36.87■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDY2AQ9Y6F7 541 aa36.87■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIP14410 1827 aa36.86■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM62Q0P6H9 643 aa36.86■■■■□ 3.49
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC39Q9UFE4 941 aa36.86■■■■□ 3.49
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GPNMBQ14956 572 aa36.85■■■■□ 3.49
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PLCG1P19174 1290 aa36.84■■■■□ 3.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB128Q7Z7B8 93 aa36.84■■■■□ 3.49
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC42EP1Q00587 391 aa36.82■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHB4P54760 987 aa36.81■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
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