RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 MUTP22033 750 aa25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 TCTN1Q2MV58 587 aa25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 PPME1Q9Y570 386 aa25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 TANC1Q9C0D5 1861 aa25.15■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 PFKMP08237 780 aa25.14■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 RARRES1P49788 294 aa25.14■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 AKT3Q9Y243 479 aa25.14■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
BRF1-216ENST00000550208 M0QZ92 97 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 GPR32O75388 356 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 RFC5P40937 340 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 LPIN1Q14693 890 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 STK38Q15208 465 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 HERVK_113Q902F9 699 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 AK8Q96MA6 479 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 CLIC6Q96NY7 704 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 PNMA5Q96PV4 448 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 MAP7D2Q96T17 732 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 CSRNP2Q9H175 543 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 GINS2Q9Y248 185 aa25.13■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 A0A1W2PPC1 479 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 GHRP10912 638 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 DNM2P50570 870 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 KIZQ2M2Z5 673 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 SPECC1Q5M775 1068 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 FBXO47Q5MNV8 452 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 CABP7Q86V35 215 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 SLC7A3Q8WY07 619 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 TMEM143Q96AN5 459 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 PLIN2Q99541 437 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 E9PMD0 336 aa25.11■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 DDIT3P35638 169 aa25.11■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 GRB10Q13322 594 aa25.11■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 EMC2Q15006 297 aa25.11■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25.11■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 ADAMTS10Q9H324 1103 aa25.11■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.11■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.11■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 SPTLC2O15270 562 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 ACTN1P12814 892 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 UBA7P41226 1012 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 HYIQ5T013 277 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 RASIP1Q5U651 963 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 USP49Q70CQ1 688 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 KCNK18Q7Z418 384 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 SEPT8Q92599 483 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 DNM3Q9UQ16 869 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 DGAT1O75907 488 aa25.09■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 YEATS4O95619 227 aa25.09■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 GPC3P51654 580 aa25.09■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 ATL3Q6DD88 541 aa25.09■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 KSR1Q8IVT5 923 aa25.09■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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BRF1-216ENST00000550208 EPSTI1Q96J88 318 aa25.09■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 OSMRQ99650 979 aa25.09■■□□□ 1.61
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BRF1-216ENST00000550208 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.09■■□□□ 1.61
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BRF1-216ENST00000550208 SIP14410 1827 aa25.08■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.08■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 ZBBXA8MT70 800 aa25.08■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 EYA4O95677 639 aa25.08■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 CD52P31358 61 aa25.08■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 PADI6Q6TGC4 694 aa25.08■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.08■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 RHPN2Q8IUC4 686 aa25.08■■□□□ 1.61
BRF1-216ENST00000550208 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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