RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 ADCK5Q3MIX3 580 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 TRIM67Q6ZTA4 783 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 RASEFQ8IZ41 740 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 PBXIP1Q96AQ6 731 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 CWH43Q9H720 699 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 PIEZO1Q92508 2521 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 TMEM221A6NGB7 291 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 M0R296 226 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 GPR32O75388 356 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 PSAPP07602 524 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 FAM189BP81408 668 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 ZXDAP98168 799 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 DUSP6Q16828 381 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 C6orf50Q9HD87 102 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 GABBR1Q9UBS5 961 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CS-214ENST00000548849 TECTAO75443 2155 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 FSD2A1L4K1 749 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 LAG3P18627 525 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP19.26■□□□□ 0.675e-6■■□□□ 14.3
CS-214ENST00000548849 SETQ01105 290 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 APOBRQ0VD83 1088 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 KRT32Q14532 448 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 TSGA10IPQ3SY00 556 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 PLPP4Q5VZY2 271 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 VN1R2Q8NFZ6 395 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 CRYGNQ8WXF5 182 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 CEP131Q9UPN4 1083 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 AKT3Q9Y243 479 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 SAMM50Q9Y512 469 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 WDFY4Q6ZS81 3184 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 FSCN2O14926 492 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 ADAMTS3O15072 1205 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 MAGEB2O15479 319 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 SRGAP2BP0DMP2 458 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 CLCN3P51790 818 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 DSC3Q14574 896 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 PRR16Q569H4 304 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 MCTP2Q6DN12 878 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 EFCAB12Q6NXP0 572 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 ZMYND12Q9H0C1 365 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 LZTS1Q9Y250 596 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 ZNF318Q5VUA4 2279 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 ESYT2A0FGR8 921 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 HOXA2O43364 376 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 TMOD1P28289 359 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 TECP42680 631 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 RCAN1P53805 252 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 PLCB3Q01970 1234 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 ABI1Q8IZP0 508 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 SUSD6Q92537 303 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 CASD1Q96PB1 797 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 MAP7D2Q96T17 732 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 TCF25Q9BQ70 676 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 TMEM117Q9H0C3 514 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 TRIOO75962 3097 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 CPA1P15085 419 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 GNA11P29992 359 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 PKN1Q16512 942 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 IER5LQ5T953 404 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 LLGL2Q6P1M3 1020 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 KCNT2Q6UVM3 1135 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 LRRC55Q6ZSA7 311 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 SKAP1Q86WV1 359 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 LRRC71Q8N4P6 559 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 FAM167AQ96KS9 214 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 APOL5Q9BWW9 433 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 NRBP2Q9NSY0 501 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 PBX3P40426 434 aa19.22■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 KRT17Q04695 432 aa19.22■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 SIGLEC14Q08ET2 396 aa19.22■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 ANKRD54Q6NXT1 300 aa19.22■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa19.22■□□□□ 0.67
CS-214ENST00000548849 Q6ZUG5 572 aa19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms