RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 HERVK_113Q902F9 699 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CEP170P1Q96L14 293 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 USP28Q96RU2 1077 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 AKT3Q9Y243 479 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 GINS2Q9Y248 185 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 TTC3P53804 2025 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 MAGEB2O15479 319 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 GPR32O75388 356 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 LYPLA2O95372 231 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 F13A1P00488 732 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 RPA1P27694 616 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 RARRES1P49788 294 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 DEFB103AP81534 67 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 LPIN1Q14693 890 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 PTPAQ15257 358 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 KIZQ2M2Z5 673 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 XKR9Q5GH70 373 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 OSMRQ99650 979 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 M0QZ92 97 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 ACTN1P12814 892 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CD52P31358 61 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 GPC3P51654 580 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 BECN1Q14457 450 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 EMC2Q15006 297 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 IER5Q5VY09 327 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 KCNK18Q7Z418 384 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 KSR1Q8IVT5 923 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 ERMNQ8TAM6 284 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 TMEM143Q96AN5 459 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 MAP7D2Q96T17 732 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 PLIN2Q99541 437 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 RAB34Q9BZG1 259 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 TRIP11Q15643 1979 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 REV3LO60673 3130 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 E9PMD0 336 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 BAIAP3O94812 1187 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 BRD1O95696 1058 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 BMP15O95972 392 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 FGFR4P22455 802 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 TMOD1P28289 359 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 PBX2P40425 430 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 RFC5P40937 340 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 RABGGTBP53611 331 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 GRB10Q13322 594 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 PDIA5Q14554 519 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 SPECC1Q5M775 1068 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 KRT79Q5XKE5 535 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 FAM228AQ86W67 206 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 NME8Q8N427 588 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 LRRC15Q8TF66 581 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 SEPT8Q92599 483 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 CLIC6Q96NY7 704 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-211ENST00000548041 PNMA5Q96PV4 448 aa9.61□□□□□ -0.87
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