RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545698.1

TDG-210, Transcript of thymine DNA glycosylase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TDG, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDG-210ENST00000545698 HCSTQ9UBK5 93 aa21.55■■□□□ 1.04
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TDG-210ENST00000545698 VTNP04004 478 aa21.54■■□□□ 1.04
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TDG-210ENST00000545698 ATP4AP20648 1035 aa21.54■■□□□ 1.04
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TDG-210ENST00000545698 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa21.54■■□□□ 1.04
TDG-210ENST00000545698 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.53■■□□□ 1.04
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TDG-210ENST00000545698 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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TDG-210ENST00000545698 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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TDG-210ENST00000545698 AKT3Q9Y243 479 aa21.52■■□□□ 1.04
TDG-210ENST00000545698 SAMM50Q9Y512 469 aa21.52■■□□□ 1.04
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TDG-210ENST00000545698 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
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TDG-210ENST00000545698 KRT32Q14532 448 aa21.51■■□□□ 1.03
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TDG-210ENST00000545698 MCTP2Q6DN12 878 aa21.51■■□□□ 1.03
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TDG-210ENST00000545698 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.48■■□□□ 1.03
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TDG-210ENST00000545698 RNF169Q8NCN4 708 aa21.48■■□□□ 1.03
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TDG-210ENST00000545698 SCLT1Q96NL6 688 aa21.48■■□□□ 1.03
TDG-210ENST00000545698 CASD1Q96PB1 797 aa21.48■■□□□ 1.03
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