RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 ARID3CA6NKF2 412 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 SPDYE6P0CI01 402 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 PIK3R1P27986 724 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 IL12AP29459 219 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 CCZ1BP86790 482 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 PRPSAP1Q14558 356 aa3.35□□□□□ -1.87
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JMJD1C-210ENST00000542921 C6orf183Q5T699 404 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 HAUS3Q68CZ6 603 aa3.35□□□□□ -1.87
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JMJD1C-210ENST00000542921 PROM2Q8N271 834 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 CCNYQ8ND76 341 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.35□□□□□ -1.87
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JMJD1C-210ENST00000542921 RDH8Q9NYR8 311 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 EFR3BQ9Y2G0 817 aa3.35□□□□□ -1.87
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JMJD1C-210ENST00000542921 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF839A8K0R7 811 aa3.35□□□□□ -1.87
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JMJD1C-210ENST00000542921 SLC39A6Q13433 755 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 CYP51A1Q16850 503 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 UVSSAQ2YD98 709 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 SMIM5Q71RC9 77 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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