RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	NTRK3	Q16288	839 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CD207	Q9UJ71	328 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777		C9IYK1	514 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	GPR32	O75388	356 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PSMA5	P28066	241 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FAM228A	Q86W67	206 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	AAAS	Q9NRG9	546 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	WDR81	Q562E7	1941 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MAGEB2	O15479	319 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	IFNAR1	P17181	557 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CLCN3	P51790	818 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	EFHB	Q8N7U6	833 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	LENG9	Q96B70	501 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FAM167A	Q96KS9	214 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	WDR64	B1ANS9	1081 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	EDIL3	O43854	480 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NRIP1	P48552	1158 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FAM189B	P81408	668 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	DSC3	Q14574	896 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	DISC1	Q9NRI5	854 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	AKT3	Q9Y243	479 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		18.15	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MSH4	O15457	936 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	REC8	O95072	547 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	EYA4	O95677	639 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	FGFR1	P11362	822 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TMOD1	P28289	359 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	USP11	P51784	963 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	NLRP5	P59047	1200 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	UBE3A	Q05086	875 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	MAP7D2	Q96T17	732 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TLE6	Q9H808	572 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CLEC1B	Q9P126	229 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	HCST	Q9UBK5	93 aa		18.14	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF862	O60290	1169 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	GAS7	O60861	476 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	FGF18	O76093	207 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	OAT	P04181	439 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	EVC	P57679	992 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	RIT2	Q99578	217 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CWH43	Q9H720	699 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TLR9	Q9NR96	1032 aa		18.13	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CHMP2A	O43633	222 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SFN	P31947	248 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PRKCE	Q02156	737 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	COASY	Q13057	564 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	RNF135	Q8IUD6	432 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TBCK	Q8TEA7	893 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SLC5A5	Q92911	643 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PER2	O15055	1255 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	HOXA2	O43364	376 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	GLP2R	O95838	553 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	LAG3	P18627	525 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	JAK3	P52333	1124 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ERVFC1	P60507	584 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49

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