RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.43■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.43■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.43■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 COPB2P35606 906 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 QPCTQ16769 361 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 TGFB1I1O43294 461 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC26A4O43511 780 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 TRAPPC3O43617 180 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SERPINB2P05120 415 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 C6orf89Q6UWU4 347 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 CEP89Q96ST8 783 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 DNAJC18Q9H819 358 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 AMFRQ9UKV5 643 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 HLA-DOAP06340 250 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 PPP2R2AP63151 447 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SLFN13Q68D06 897 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 FERP16591 822 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 STAT1P42224 750 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 MTMR3Q13615 1198 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 BMT2Q1RMZ1 405 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 KRT71Q3SY84 523 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 KSR1Q8IVT5 923 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 CABS1Q96KC9 395 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 MSH4O15457 936 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 ANXA13P27216 316 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 NMT1P30419 496 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 CACNB3P54284 484 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 AP3B2Q13367 1082 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 Q4G0T1 1027 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 DCAF12L1Q5VU92 463 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC13Q8IYE1 715 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 BORCS6Q96GS4 357 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 C8orf37Q96NL8 207 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 F8VZ95 297 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 EML1O00423 815 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SEC14L1Q92503 715 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 INTUQ9ULD6 942 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 FOCADQ5VW36 1801 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.39■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 NPEPPSP55786 919 aa23.39■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 TCP10Q12799 353 aa23.39■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 COG2Q14746 738 aa23.39■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 VCPKMTQ9H867 229 aa23.39■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.39■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 BTAF1O14981 1849 aa23.39■■□□□ 1.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SOX5P35711 763 aa23.39■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 USP8P40818 1118 aa23.39■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.39■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 RAPGEF5Q92565 580 aa23.39■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 VAV3Q9UKW4 847 aa23.39■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 ZBTB39O15060 712 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 TBX3O15119 743 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 DOK7Q18PE1 504 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 SPRED3Q2MJR0 410 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 GLG1Q92896 1179 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 AGBL2Q5U5Z8 902 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 NGLY1Q96IV0 654 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 AMNQ9BXJ7 453 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 GGA2Q9UJY4 613 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.37■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 MYCT1Q8N699 235 aa23.37■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 MDM1Q8TC05 714 aa23.37■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 RFFLQ8WZ73 363 aa23.37■■□□□ 1.33
TMEM200B-202ENST00000521452 ARHGEF26Q96DR7 871 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms