RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519485.1

CSMD3-209, Transcript of CUB and Sushi multiple domains 3, human

TSL 3

Gene CSMD3, Length 452 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSMD3-209	ENST00000519485	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CLIP1	P30622	1438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	TRAF5	O00463	557 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CD83	Q01151	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CDC6	Q99741	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CUX2	O14529	1486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	AQP7	O14520	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	MC4R	P32245	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	PTGS2	P35354	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CRHR2	Q13324	411 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	RIN1	Q13671	783 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	MOGS	Q13724	837 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	BLACE	A4D250	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	ARVCF	O00192	962 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	BMP5	P22003	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	PROZ	P22891	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	ST5	P78524	1137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	LENG9	Q96B70	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	GSTA4	O15217	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	GC	P02774	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	NAT1	P18440	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SCNN1G	P51170	649 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	WIZ	O95785	1651 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	APP	P05067	770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	LMO1	P25800	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	ADCY7	P51828	1080 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	JAM2	P57087	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CRY1	Q16526	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485		Q6ZRM9	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	HAS1	Q92839	578 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD3-209	ENST00000519485	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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