RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC66A2RUB6 948 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 FOXP2O15409 715 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 EFCAB14O75071 495 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 NPTXRO95502 500 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 PYGMP11217 842 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 MC4RP32245 332 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADRA1BP35368 520 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 RAB33AQ14088 237 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF627Q7L945 461 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SYNE4Q8N205 404 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 HAS1Q92839 578 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 FOXB1Q99853 325 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TTPALQ9BTX7 342 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SMURF1Q9HCE7 757 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 CBLCQ9ULV8 474 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRAF6Q9Y4K3 522 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 BLACEA4D250 179 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 HIP1RO75146 1068 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TCF3P15923 654 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRT15P19012 456 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 JAM2P57087 298 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 RASGRF1Q13972 1273 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 HTR3DQ70Z44 454 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 OSTM1Q86WC4 334 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 NOSTRINQ8IVI9 506 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 HIPK4Q8NE63 616 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ASB15Q8WXK1 588 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 GBP4Q96PP9 640 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIM55Q9BYV6 548 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 GOLGA6L22H0YM25 854 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAFGO15525 162 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 GCP02774 474 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 MMEP08473 750 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRT4P19013 534 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 FNTBP49356 437 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADCY7P51828 1080 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TAP1Q03518 808 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC142Q17RM4 750 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRCH2Q5VUJ6 765 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 NBPF6Q5VWK0 638 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q6ZPA2 131 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRIMA1Q86XR5 153 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM176AQ96HP8 235 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 NBPF4Q96M43 638 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 MSRB2Q9Y3D2 182 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDPK1O15530 556 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADCY3O60266 1144 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 MFAP3LO75121 409 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 LMNAP02545 664 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 BMP5P22003 454 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 STAT5BP51692 787 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 COL10A1Q03692 680 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 DGKDQ16760 1214 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRSAM1Q6UWE0 723 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 CKAP2LQ8IYA6 745 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 DLG3Q92796 817 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TCF25Q9BQ70 676 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR87Q9BY21 358 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC113Q9H0I3 377 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC12A8A0AV02 714 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 UNCXA6NJT0 531 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCDO00767 359 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 DNM2P50570 870 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCNN1GP51170 649 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC25A3Q00325 362 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ROM1Q03395 351 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms