RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513423.1

FGFR4-215, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, human

TSL 2

Gene FGFR4, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGFR4-215	ENST00000513423	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		15.2	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	GPR32	O75388	356 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	TMOD1	P28289	359 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	RFC5	P40937	340 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	HYI	Q5T013	277 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	AK8	Q96MA6	479 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	SI	P14410	1827 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	TET1	Q8NFU7	2136 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	VTN	P04004	478 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	LPIN1	Q14693	890 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	ATL3	Q6DD88	541 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	PNMA5	Q96PV4	448 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	CEP290	O15078	2479 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	ARID2	Q68CP9	1835 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423		M0QZ92	97 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	DNM2	P50570	870 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	GPC3	P51654	580 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	GRB10	Q13322	594 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	EMC2	Q15006	297 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	USP38	Q8NB14	1042 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	CLIC6	Q96NY7	704 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	MAP7D2	Q96T17	732 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	AKT3	Q9Y243	479 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	SLC26A4	O43511	780 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	DGAT1	O75907	488 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	YEATS4	O95619	227 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	GHR	P10912	638 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	ACTN1	P12814	892 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	STK38	Q15208	465 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	USP49	Q70CQ1	688 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	KCNK18	Q7Z418	384 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	CABP7	Q86V35	215 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	SEPT8	Q92599	483 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	TMEM143	Q96AN5	459 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	CSRNP2	Q9H175	543 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423		E9PMD0	336 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	SPTLC2	O15270	562 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	PPP6R2	O75170	966 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	BAIAP3	O94812	1187 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	EYA4	O95677	639 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	ARL2	P36404	184 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	UBA7	P41226	1012 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	CDC42EP1	Q00587	391 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	IKBKE	Q14164	716 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	PADI6	Q6TGC4	694 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	KSR1	Q8IVT5	923 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	TCP11	Q8WWU5	503 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	EPSTI1	Q96J88	318 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	OSMR	Q99650	979 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FGFR4-215	ENST00000513423	MTR	Q99707	1265 aa		15.15	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms