RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510801.5

COPS4-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, human

TSL 5

Gene COPS4, Length 381 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS4-208	ENST00000510801	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ZNF174	Q15697	407 aa		13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	RAD9A	Q99638	391 aa		13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.94	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	GPR182	O15218	404 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	PBX2	P40425	430 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	DNM2	P50570	870 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	GPC3	P51654	580 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	CLCN3	P51790	818 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	DEFB103A	P81534	67 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	PTGDR	Q13258	359 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	POTEM	A6NI47	508 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ENPP3	O14638	875 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	BMP15	O95972	392 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	CD52	P31358	61 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TEC	P42680	631 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	MTERF2	Q49AM1	385 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ASAP2	O43150	1006 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	SLC26A4	O43511	780 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TLL1	O43897	1013 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	DGAT1	O75907	488 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	VTN	P04004	478 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	SYT1	P21579	422 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	RARRES1	P49788	294 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	PAK2	Q13177	524 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801		Q7L0L9	218 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	RABGGTB	P53611	331 aa		13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	NPEPPS	P55786	919 aa		13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	DSC3	Q14574	896 aa		13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	NBR1	Q14596	966 aa		13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	HYI	Q5T013	277 aa		13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.9	□□□□□ -0.18
COPS4-208	ENST00000510801	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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