RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 NPEPPSP55786 919 aa29.91■■■□□ 2.38
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SH3BP2-212ENST00000508338 USP38Q8NB14 1042 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 SUGCTQ9HAC7 445 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 KIAA1024Q9UPX6 916 aa29.91■■■□□ 2.38
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SH3BP2-212ENST00000508338 ACTN1P12814 892 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT85P78386 507 aa29.9■■■□□ 2.38
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SH3BP2-212ENST00000508338 PRO3102Q9H379 93 aa29.89■■■□□ 2.38
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SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGEF35A5YM69 484 aa29.88■■■□□ 2.37
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SH3BP2-212ENST00000508338 CHRNA1P02708 482 aa29.87■■■□□ 2.37
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SH3BP2-212ENST00000508338 EMC2Q15006 297 aa29.87■■■□□ 2.37
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SH3BP2-212ENST00000508338 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.87■■■□□ 2.37
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SH3BP2-212ENST00000508338 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
SH3BP2-212ENST00000508338 DEFB128Q7Z7B8 93 aa29.86■■■□□ 2.37
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SH3BP2-212ENST00000508338 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
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