RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490510.5

PITRM1-211, Transcript of pitrilysin metallopeptidase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITRM1, Length 778 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-211ENST00000490510 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.62■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.62■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.62■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 PLVAPQ9BX97 442 aa21.62■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.62■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 RGS18Q9NS28 235 aa21.62■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.62■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.62■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 C9IYK1 514 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 PFKFB2O60825 505 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 CAMK1Q14012 370 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 COL19A1Q14993 1142 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 INF2Q27J81 1249 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 NEK9Q8TD19 979 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 AKT3Q9Y243 479 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.61■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 DENND3A2RUS2 1198 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 CDKL5O76039 1030 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 CSPG5O95196 566 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 CTDNEP1O95476 244 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 ODR4Q5SWX8 454 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 RDM1Q8NG50 284 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 MAP7D2Q96T17 732 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.6■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 STK36Q9NRP7 1315 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 SLC37A4O43826 429 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 STBD1O95210 358 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 MMP1P03956 469 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 ITGB1P05556 798 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 IL9P15248 144 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 DNAJB1P25685 340 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 TMOD1P28289 359 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 AK2P54819 239 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 ANAPC15P60006 121 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 DSC3Q14574 896 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 P2RX5Q93086 422 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 CD320Q9NPF0 282 aa21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 TMEM150BA6NC51 233 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 FAM189BP81408 668 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 HYAL1Q12794 435 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 LETM2Q2VYF4 491 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 OXER1Q8TDS5 423 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 CEP89Q96ST8 783 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 CLDND1Q9NY35 253 aa21.58■■□□□ 1.05
PITRM1-211ENST00000490510 GRXCR2A6NFK2 248 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 LTBRP36941 435 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 GPC3P51654 580 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 DRP2Q13474 957 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 MTERF2Q49AM1 385 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 XKR3Q5GH77 459 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 HCSTQ9UBK5 93 aa21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 EML1O00423 815 aa21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 IRS1P35568 1242 aa21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 NECAB1Q8N987 351 aa21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.56■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 NCK2O43639 380 aa21.55■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 LARGE1O95461 756 aa21.55■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 FGFR1P11362 822 aa21.55■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PITRM1-211ENST00000490510 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.9 ms