RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	C7orf31	Q8N865	590 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC138	Q96M89	665 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163		A0A1W2PRQ8	180 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NDUFS2	O75306	463 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	LCP1	P13796	627 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ETV3	P41162	512 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	MAN2A1	Q16706	1144 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PPM1J	Q5JR12	505 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SESTD1	Q86VW0	696 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	FOXB1	Q99853	325 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TAF4	O00268	1085 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GAS7	O60861	476 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ARIH2	O95376	493 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CD4	P01730	458 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	BMP2	P12643	396 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	HTR1B	P28222	390 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	MCAM	P43121	646 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ARL4D	P49703	201 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PNLIPRP1	P54315	467 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CMIP	Q8IY22	773 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	FGD4	Q96M96	766 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	C7orf26	Q96N11	449 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SP110	Q9HB58	689 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CAPN8	A6NHC0	703 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TMCC2	O75069	709 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	MPIG6B	O95866	241 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GRK2	P25098	689 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GRK3	P35626	688 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PRIM2	P49643	509 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TEK	Q02763	1124 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	LSAMP	Q13449	338 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM14	Q14142	442 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	UVSSA	Q2YD98	709 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	KRT73	Q86Y46	540 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NELL1	Q92832	810 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	BOC	Q9BWV1	1114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	FBXO10	Q9UK96	956 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM82	A0PJX8	343 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GSTA4	O15217	222 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PGM3	O95394	542 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84	3e-8	■□□□□ 10.3
UBXN4-208	ENST00000490163	CKMT1A	P12532	417 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	MC4R	P32245	332 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GBP1	P32455	592 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GSTM4	Q03013	218 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ZACN	Q401N2	412 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NME9	Q86XW9	330 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	BTBD7	Q9P203	1132 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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