RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 EFHBQ8N7U6 833 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 LENG9Q96B70 501 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 CD207Q9UJ71 328 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 EDIL3O43854 480 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 EYA4O95677 639 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 IFNAR1P17181 557 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PSMA5P28066 241 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 EVCP57679 992 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 CLUL1Q15846 466 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 METTL13Q8N6R0 699 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM167AQ96KS9 214 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 OSMRQ99650 979 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 AAASQ9NRG9 546 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 WDR64B1ANS9 1081 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 VTNP04004 478 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 NDUFV1P49821 464 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 USP11P51784 963 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 DSC3Q14574 896 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP1R16BQ96T49 567 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 SH3GLB2Q9NR46 395 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM161AQ9NX61 479 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 SAMM50Q9Y512 469 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 MUC6Q6W4X9 2439 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TMOD1P28289 359 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 COASYQ13057 564 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 RIT2Q99578 217 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 DISC1Q9NRI5 854 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 CLEC1BQ9P126 229 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 MSH4O15457 936 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF862O60290 1169 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 PPFIA3O75145 1194 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 REC8O95072 547 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 NRIP1P48552 1158 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 CLCN3P51790 818 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 SMRP1Q8NCR6 262 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 MAP7D2Q96T17 732 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 CWH43Q9H720 699 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 AKT3Q9Y243 479 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 FGF18O76093 207 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 OATP04181 439 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 SFNP31947 248 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC5A5Q92911 643 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TLR9Q9NR96 1032 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 FSD2A1L4K1 749 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 HOXA2O43364 376 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 GAS7O60861 476 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 GLP2RO95838 553 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 FGFR1P11362 822 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 LAG3P18627 525 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 JAK3P52333 1124 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 NLRP5P59047 1200 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 PLCB3Q01970 1234 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 RUFY3Q7L099 469 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 THNSL1Q8IYQ7 743 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TEKT3Q9BXF9 490 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TLE6Q9H808 572 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 HCSTQ9UBK5 93 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 LZTS1Q9Y250 596 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms