RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489077.1

AC004889.1-208, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC004889.1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004889.1-208ENST00000489077 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PADI3Q9ULW8 664 aa6.14□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.14□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 AKT3Q9Y243 479 aa6.14□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.14□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SIP14410 1827 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PIEZO1Q92508 2521 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PER2O15055 1255 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ZBTB43O43298 467 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 HBP1O60381 514 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 FGF18O76093 207 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 LAG3P18627 525 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 KLRC1P26715 233 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 TMOD1P28289 359 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SMARCA1P28370 1054 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PPM1AP35813 382 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 TECP42680 631 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 GATMP50440 423 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ANTXR2P58335 489 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 MGAT3Q09327 533 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 AP3B2Q13367 1082 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PKN1Q16512 942 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 KIZQ2M2Z5 673 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 CEP55Q53EZ4 464 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 TMC7Q7Z402 723 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 EFHBQ8N7U6 833 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 FANCBQ8NB91 859 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 OSMRQ99650 979 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 APOL5Q9BWW9 433 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ANO3Q9BYT9 981 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 NR2E1Q9Y466 385 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SQORQ9Y6N5 450 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 MYH6P13533 1939 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.13□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SMCO2A6NFE2 343 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC27A2O14975 620 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 MAP3K7O43318 606 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 NFASCO94856 1347 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PSAPP07602 524 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 FGFR1P11362 822 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 LIFRP42702 1097 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ADAM17P78536 824 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 UBE3AQ05086 875 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ADAM15Q13444 863 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 CES5AQ6NT32 575 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 PACS2Q86VP3 889 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 LRRC43Q8N309 656 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 NLRP7Q8WX94 980 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 EDAQ92838 391 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 MAP4K1Q92918 833 aa6.12□□□□□ -1.43
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms