RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487270.5

RAD51B-210, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 2,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-210ENST00000487270 NPR1P16066 1061 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 ALDH1B1P30837 517 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 NAA35Q5VZE5 725 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 SIX2Q9NPC8 291 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 AMACRQ9UHK6 382 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 VAV3Q9UKW4 847 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PLAAQ9Y263 795 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 BCS1LQ9Y276 419 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 EVI5O60447 810 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 SLITRK3O94933 977 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 TRIM49P0CI25 452 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 TRIM49CP0CI26 452 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 ECE1P42892 770 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 LIG3P49916 1009 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 GALCP54803 685 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 CCDC174Q6PII3 467 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PODNQ7Z5L7 613 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 WHAMMQ8TF30 809 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PBKQ96KB5 322 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 FAM107BQ9H098 131 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.23□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 NR1D1P20393 614 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PRKCIP41743 596 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 STAT1P42224 750 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 SLC20A2Q08357 652 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 MSL1Q68DK7 614 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PACS2Q86VP3 889 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 SCFD2Q8WU76 684 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 WDR18Q9BV38 432 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 ISCUQ9H1K1 167 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 TTI1O43156 1089 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 DAPK3O43293 454 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 SLC26A4O43511 780 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 LRRN2O75325 713 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 CIITAP33076 1130 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 FLT3P36888 993 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 HSD17B3P37058 310 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 SEC24CP53992 1094 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 JAM2P57087 298 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 SKOR1P84550 965 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 CBWD6Q4V339 395 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 ODR4Q5SWX8 454 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PPM1EQ8WY54 764 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 GMCL1Q96IK5 515 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 CSRNP1Q96S65 589 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 IDI2Q9BXS1 227 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 DPH5Q9H2P9 285 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 PARVGQ9HBI0 331 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 119.7
RAD51B-210ENST00000487270 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.22□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa7.21□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 ECE2O60344 883 aa7.21□□□□□ -1.25
RAD51B-210ENST00000487270 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms