RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.92■■□□□ 1.42
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USP13-202ENST00000482333 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 PLS3P13797 630 aa23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 NFIL3Q16649 462 aa23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.92■■□□□ 1.42
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USP13-202ENST00000482333 SLC25A27O95847 323 aa23.91■■□□□ 1.42
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USP13-202ENST00000482333 KCNH2Q12809 1159 aa23.91■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 SNAPC2Q13487 334 aa23.91■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.91■■□□□ 1.42
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USP13-202ENST00000482333 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.91■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.91■■□□□ 1.42
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USP13-202ENST00000482333 GBP3Q9H0R5 595 aa23.91■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa23.91■■□□□ 1.42
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USP13-202ENST00000482333 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
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USP13-202ENST00000482333 PGK2P07205 417 aa23.89■■□□□ 1.42
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USP13-202ENST00000482333 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.42
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USP13-202ENST00000482333 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
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USP13-202ENST00000482333 PDXDC1Q6P996 788 aa23.86■■□□□ 1.41
USP13-202ENST00000482333 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.86■■□□□ 1.41
USP13-202ENST00000482333 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.86■■□□□ 1.41
USP13-202ENST00000482333 CEP72Q9P209 647 aa23.86■■□□□ 1.41
USP13-202ENST00000482333 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
USP13-202ENST00000482333 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.85■■□□□ 1.41
USP13-202ENST00000482333 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
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USP13-202ENST00000482333 ACCSQ96QU6 501 aa23.85■■□□□ 1.41
USP13-202ENST00000482333 MMP19Q99542 508 aa23.85■■□□□ 1.41
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