RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 DGAT1O75907 488 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 UBE2HP62256 183 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 RBL2Q08999 1139 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 DRP2Q13474 957 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 RPAINQ86UA6 219 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 IQUBQ8NA54 791 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 DHX58Q96C10 678 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 MTRQ99707 1265 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 CUEDC2Q9H467 287 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 CYP2C9P11712 490 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 CYP11B2P19099 503 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 SYKP43405 635 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 ARSHQ5FYA8 562 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 CLTBP09497 229 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 LIG1P18858 919 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 CLCN3P51790 818 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 KCND2Q9NZV8 630 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 NOD1Q9Y239 953 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 SLFN14P0C7P3 912 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 GUCY2CP25092 1073 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 RGS19P49795 217 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 MAPK7Q13164 816 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 LONRF3Q496Y0 759 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 METTL13Q8N6R0 699 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 RETREG2Q8NC44 543 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 USP25Q9UHP3 1055 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 EVPLQ92817 2033 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 ARL2P36404 184 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 GPBP1Q86WP2 473 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 DAW1Q8N136 415 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 TMEM143Q96AN5 459 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 TNMDQ9H2S6 317 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 MYMKA6NI61 221 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 PITPNM1O00562 1244 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 KIAA0355O15063 1070 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 CAND2O75155 1236 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 ZNF202O95125 648 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 SV2BQ7L1I2 683 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 CAGE1Q8TC20 777 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTB-210ENST00000477812 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 NR1I2O75469 434 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CKBP12277 381 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 MGAT3Q09327 533 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 IER5Q5VY09 327 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 REEP2Q9BRK0 252 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TIPINQ9BVW5 301 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 HIP1RO75146 1068 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 VTNP04004 478 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 ITGB8P26012 769 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TMOD1P28289 359 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 MCM4P33991 863 aa22.13■■□□□ 1.13
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