RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474040.5

HOXB-AS3-206, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 741 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GIT2Q14161 759 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GRIK4Q16099 956 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LMBR1Q8WVP7 490 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLC7A3Q8WY07 619 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 REEP2Q9BRK0 252 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CENPFP49454 3210 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GRIN2DO15399 1336 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 A0A1W2PQY0 241 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MAGEB2O15479 319 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KLRC4O43908 158 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 USO1O60763 962 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SMC2O95347 1197 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CASP1P29466 404 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF131P52739 623 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MAPK7Q13164 816 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 EMC2Q15006 297 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 UNC13DQ70J99 1090 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DAW1Q8N136 415 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C7orf31Q8N865 590 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GSDMAQ96QA5 445 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KRT18P05783 430 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GNAT1P11488 350 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RTP1P59025 263 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ASIC1P78348 528 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 EHHADHQ08426 723 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HIC1Q14526 733 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KCNB1Q14721 858 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MTHFD1LQ6UB35 978 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DYMQ7RTS9 669 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SMARCE1Q969G3 411 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DRC1Q96MC2 740 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SETD4Q9NVD3 440 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HIP1RO75146 1068 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 COL6A1P12109 1028 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KLRC1P26715 233 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ITGA7Q13683 1181 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RETREG2Q8NC44 543 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KIFAP3Q92845 792 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C17orf75Q9HAS0 396 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 STARD7Q9NQZ5 370 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TBCAO75347 108 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RHOBTB3O94955 611 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RSPH10BP0C881 870 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GAP43P17677 238 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ARL2P36404 184 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 IGBP1P78318 339 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 IER5Q5VY09 327 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TCP11Q8WWU5 503 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PARVGQ9HBI0 331 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PANK4Q9NVE7 773 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RMND1Q9NWS8 449 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SEL1LQ9UBV2 794 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FAM13AO94988 1023 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PLS3P13797 630 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-206ENST00000474040 IDEP14735 1019 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CDK7P50613 346 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CHMP4BP1P59074 171 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-206ENST00000474040 COASYQ13057 564 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms