RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRPF40A-208ENST00000472760 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC38A3Q99624 504 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRPF40A-208ENST00000472760 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRPF40A-208ENST00000472760 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.48□□□□□ -1.37
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PRPF40A-208ENST00000472760 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
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PRPF40A-208ENST00000472760 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
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PRPF40A-208ENST00000472760 ORAI2Q96SN7 254 aa6.47□□□□□ -1.37
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PRPF40A-208ENST00000472760 MTG2Q9H4K7 406 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-208ENST00000472760 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.47□□□□□ -1.37
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PRPF40A-208ENST00000472760 USP18Q9UMW8 372 aa6.46□□□□□ -1.38
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PRPF40A-208ENST00000472760 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF385BQ569K4 471 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRPF40A-208ENST00000472760 AKAP10O43572 662 aa6.44□□□□□ -1.38
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PRPF40A-208ENST00000472760 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 KNG1P01042 644 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 LGALS4P56470 323 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 KRT85P78386 507 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 DGKDQ16760 1214 aa6.44□□□□□ -1.38
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