RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465199.5

C1orf35-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 5

Gene C1orf35, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-202ENST00000465199 TMEM199Q8N511 208 aa24.54■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.54■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.54■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.54■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 SLC26A4O43511 780 aa24.53■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.522e-7■■□□□ 11.8
C1orf35-202ENST00000465199 DRP2Q13474 957 aa24.53■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 RESP18Q5W5W9 173 aa24.53■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.53■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.53■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 HIPK3Q9H422 1215 aa24.53■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 NOD1Q9Y239 953 aa24.53■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 TCHHQ07283 1943 aa24.53■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 EYA4O95677 639 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 CSF2RAP15509 400 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 ADALQ6DHV7 355 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 PANK2Q9BZ23 570 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
C1orf35-202ENST00000465199 GBF1Q92538 1859 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 CLCN3P51790 818 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 RBL2Q08999 1139 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 CALML4Q96GE6 196 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.512e-7■■□□□ 13.3
C1orf35-202ENST00000465199 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 DNM3Q9UQ16 869 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.5■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 MAGEB2O15479 319 aa24.5■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 ACRP10323 421 aa24.5■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 CCL23P55773 120 aa24.5■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.5■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.5■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.5■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 PPME1Q9Y570 386 aa24.5■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 CKBP12277 381 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 CMA1P23946 247 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 SLC12A3P55017 1021 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 E2F4Q16254 413 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 RPAINQ86UA6 219 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 METTL13Q8N6R0 699 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 PDILTQ8N807 584 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 FAM161BQ96MY7 647 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 PLA2G4BP0C869 781 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 THPOP40225 353 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 RFC5P40937 340 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 MCM6Q14566 821 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 GPNMBQ14956 572 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 EMC2Q15006 297 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 ZNF697Q5TEC3 545 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 PADI6Q6TGC4 694 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 RAD54LQ92698 747 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 HPSEQ9Y251 543 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 ARID2Q68CP9 1835 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 A0A1B0GVL5 298 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 A0A1W2PQ27 194 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 A0A1W2PQ64 194 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 A0A1W2PQD8 194 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 TXLNAP40222 546 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 MGAT3Q09327 533 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 TMEM240Q5SV17 173 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 CAGE1Q8TC20 777 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 TMEM143Q96AN5 459 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 VWCEQ96DN2 955 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 POLD4Q9HCU8 107 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 IL23AQ9NPF7 189 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 PITPNM1O00562 1244 aa24.46■■□□□ 1.51
C1orf35-202ENST00000465199 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms