RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448450.5

HTATSF1-203, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene HTATSF1, Length 1,014 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-203ENST00000448450 NOSTRINQ8IVI9 506 aa28.13■■■□□ 2.09
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HTATSF1-203ENST00000448450 FBXO22Q8NEZ5 403 aa28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-203ENST00000448450 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.13■■■□□ 2.09
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HTATSF1-203ENST00000448450 C17orf80Q9BSJ5 609 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-203ENST00000448450 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.11■■■□□ 2.09
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HTATSF1-203ENST00000448450 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.11■■■□□ 2.09
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HTATSF1-203ENST00000448450 C22orf31O95567 290 aa28.1■■■□□ 2.09
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HTATSF1-203ENST00000448450 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
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HTATSF1-203ENST00000448450 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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HTATSF1-203ENST00000448450 SH2D3AQ9BRG2 576 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1-203ENST00000448450 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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HTATSF1-203ENST00000448450 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1-203ENST00000448450 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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HTATSF1-203ENST00000448450 TPH2Q8IWU9 490 aa28.04■■■□□ 2.08
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