RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 PADI3Q9ULW8 664 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 FAM50BQ9Y247 325 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 TCHHQ07283 1943 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 KAT6AQ92794 2004 aa14.02□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.02□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 NFASCO94856 1347 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 POTEB3A0JP26 581 aa14.02□□□□□ -0.17
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PRAME-208ENST00000438888 ADAMTS3O15072 1205 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 LINC01565O15544 149 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 LTBRP36941 435 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 ZP2Q05996 745 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 POTEBQ6S5H4 581 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 TNFRSF25Q93038 417 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 PRR33A8MZF0 331 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 DCXO43602 365 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 TBX10O75333 385 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CCNE2O96020 404 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 ALADP13716 330 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 KRT76Q01546 638 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 COL19A1Q14993 1142 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 NCK2O43639 380 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 ITGB1P05556 798 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 STAG3L1P0CL83 205 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 DNAJB1P25685 340 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 IRS1P35568 1242 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 SREBF1P36956 1147 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 NDUFV1P49821 464 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 AP3B2Q13367 1082 aa14□□□□□ -0.17
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PRAME-208ENST00000438888 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 MCTP2Q6DN12 878 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
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PRAME-208ENST00000438888 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 KLHL23Q8NBE8 558 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 PLVAPQ9BX97 442 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 TMX1Q9H3N1 280 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 FAM205CA6NFA0 338 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 FAM86B1E9PN63 330 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 MEIS1O00470 390 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 MBTPS2O43462 519 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 MGEA5O60502 916 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 FAM86B2P0C5J1 330 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 KLRC1P26715 233 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CAMK1Q14012 370 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CTC1Q2NKJ3 1217 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 FAM160B1Q5W0V3 765 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 PDXDC2PQ6P474 469 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 FAM173BQ6P4H8 233 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CKAP2LQ8IYA6 745 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 ATP8B4Q8TF62 1192 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 POF1BQ8WVV4 589 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 ZNF302Q9NR11 478 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 PRKAG3Q9UGI9 489 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 CD207Q9UJ71 328 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 SQORQ9Y6N5 450 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa13.99□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 TTC3P53804 2025 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-208ENST00000438888 DENND3A2RUS2 1198 aa13.98□□□□□ -0.17
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