RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 BACH1O14867 736 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 SLC37A4O43826 429 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 ATP4AP20648 1035 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MGAT3Q09327 533 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 NR5A1Q13285 461 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 PPP2R5CQ13362 524 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TRIM29Q14134 588 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 KRT40Q6A162 431 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 RSPH3Q86UC2 560 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 DISC1Q9NRI5 854 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 SQORQ9Y6N5 450 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 ZBBXA8MT70 800 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF862O60290 1169 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 DTNBO60941 627 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CHRNA1P02708 482 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 KCNJ6P48051 423 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MCM2P49736 904 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 IKBKEQ14164 716 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TCTN1Q2MV58 587 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 LETM2Q2VYF4 491 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 NME8Q8N427 588 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 APBB2Q92870 758 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 VAV3Q9UKW4 847 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 STK24Q9Y6E0 443 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 PRR33A8MZF0 331 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 BTBD18B2RXH4 712 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 C22orf31O95567 290 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 OATP04181 439 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CTSHP09668 335 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 IGBP1P78318 339 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 PRKCEQ02156 737 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 IER5Q5VY09 327 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 SEPT8Q92599 483 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 HAS1Q92839 578 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 C8orf76Q96K31 380 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 UIMC1Q96RL1 719 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 COG5Q9UP83 839 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 SAMM50Q9Y512 469 aa9.94□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MAGEB2O15479 319 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 HRO43593 1189 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 STBD1O95210 358 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 GJB5O95377 273 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 KLRC1P26715 233 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 PTPN5P54829 565 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 DEFB103AP81534 67 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 LPIN1Q14693 890 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 UGCGQ16739 394 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 GJA10Q969M2 543 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 BACH2Q9BYV9 841 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 KIF3AQ9Y496 699 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TRPV2Q9Y5S1 764 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CACNA1AO00555 2505 aa9.93□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 KIF28PB7ZC32 967 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 M0QZ92 97 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CHMP2AO43633 222 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms