RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 THPOP40225 353 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 DNM2P50570 870 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 MFSD5Q6N075 450 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 METTL13Q8N6R0 699 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 E9PMD0 336 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 DGAT1O75907 488 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 CYP2C18P33260 490 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 FAM26DQ5JW98 314 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 ADALQ6DHV7 355 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-211ENST00000424766 IQCF3P0C7M6 154 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 IER5Q5VY09 327 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 SHC4Q6S5L8 630 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 KCNK18Q7Z418 384 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 TMEM199Q8N511 208 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 PLIN2Q99541 437 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 H0YGN5 161 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 RSPH10BP0C881 870 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 PLCG1P19174 1290 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 CCL23P55773 120 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 CDC42EP1Q00587 391 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 PADI6Q6TGC4 694 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 TCP11Q8WWU5 503 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 BADQ92934 168 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 MAP7D2Q96T17 732 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 SCN5AQ14524 2016 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 RFC2P35250 354 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 CLCN3P51790 818 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 EMC2Q15006 297 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 RESP18Q5W5W9 173 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 MTRQ99707 1265 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 STK17AQ9UEE5 414 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 M0QZ92 97 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 CHRNA1P02708 482 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 CYP11B2P19099 503 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 CMA1P23946 247 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 MGAT3Q09327 533 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 AKT3Q9Y243 479 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 ASAP2O43150 1006 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 PLA2G4BP0C869 781 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 SLC12A3P55017 1021 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 FPGSQ05932 587 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.266e-7■■□□□ 11.6
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PMS1-211ENST00000424766 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 RAD54LQ92698 747 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 SCLYQ96I15 445 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 PANK2Q9BZ23 570 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 SQORQ9Y6N5 450 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 A0A1W2PQ27 194 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 A0A1W2PQ64 194 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 A0A1W2PQD8 194 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 VTNP04004 478 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 CSF2RAP15509 400 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 DRP2Q13474 957 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 TMEM143Q96AN5 459 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 KCND2Q9NZV8 630 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 SIP14410 1827 aa22.89■■□□□ 1.26
PMS1-211ENST00000424766 A0A087X0B3 334 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GPR32O75388 356 aa22.89■■□□□ 1.25
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