RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L13C9JLJ4 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L12C9JPN9 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L11C9JVI0 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L21D6R901 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L18D6R9N7 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L22D6RA61 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L17D6RBQ6 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L19D6RCP7 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L20D6RJB6 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP-0.14□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 IPO13O94829 963 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP10-10P60014 251 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERVK11-1P61568 191 aa-0.14□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF449Q6P9G9 518 aa-0.14□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SYT12Q8IV01 421 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 NANOGP1Q8N7R0 232 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 STPG3Q8N7X2 389 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 RETREG2Q8NC44 543 aa-0.14□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ACTRT2Q8TDY3 377 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 NKD1Q969G9 470 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAML3Q96JK9 1138 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHRDL1Q9BU40 450 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS22Q9GZN4 317 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10A2Q9H208 303 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 GFOD1Q9NXC2 390 aa-0.14□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ITGAMP11215 1152 aa-0.15□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa-0.15□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR23AA6NEV1 266 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 UNC119BA6NIH7 251 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 LDB3O75112 727 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 MFAP3LO75121 409 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRYABP02511 175 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
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