RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 GAP43P17677 238 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 TPM4P67936 248 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 FANCCQ00597 558 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 PPTC7Q8NI37 304 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 IFNKQ9P0W0 207 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 EMSYQ7Z589 1322 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 GCNT3O95395 438 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 TRPV1Q8NER1 839 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 LGALS2P05162 132 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 TRIM32Q13049 653 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 PTPN21Q16825 1174 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 BSNDQ8WZ55 320 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 PLCB4Q15147 1175 aa22.26■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.26■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.26■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.26■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.26■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.26■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 DGAT1O75907 488 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 EMC2Q15006 297 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 PLS3P13797 630 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 PEX3P56589 373 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 TMEM143Q96AN5 459 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 BICDL2A1A5D9 508 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 SERPINC1P01008 464 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 MMP3P08254 477 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R2P41236 205 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 SPC24Q8NBT2 197 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 DRC1Q96MC2 740 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 INTS13Q9NVM9 706 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.24■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ELNP15502 786 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 DRP2Q13474 957 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 KIF22Q14807 665 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 TLK2Q86UE8 772 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 TSKSQ9UJT2 592 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 TRPC6Q9Y210 931 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 K7ENM7 598 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 GPR25O00155 361 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 SLC16A4O15374 487 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.23■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 PPFIA4O75335 1185 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 UBASH3AP57075 661 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 FAM167AQ96KS9 214 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 TIPINQ9BVW5 301 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 STRA6Q9BX79 667 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 EVPLQ92817 2033 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 KCNJ18B7U540 433 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R37O75864 691 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 CYBAP13498 195 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 NPTX2P47972 431 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 LRRC63Q05C16 580 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 KCNJ12Q14500 433 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms