RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391230.1

SNORD66.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 66, humanhuman

BASIC

Gene SNORD66, Length 76 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD66.1-201ENST00000391230 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 METTL7BQ6UX53 244 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARMCX2Q7L311 632 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 GPR142Q7Z601 462 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 RASAL3Q86YV0 1011 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 OR8K1Q8NGG5 319 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NPLOC4Q8TAT6 608 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 BSNDQ8WZ55 320 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ATP6V0A1Q93050 837 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 BORCS6Q96GS4 357 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ACCSQ96QU6 501 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PANX2Q96RD6 677 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NUP58Q9BVL2 599 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TIPINQ9BVW5 301 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CYP26B1Q9NR63 512 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CPA4Q9UI42 421 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 DCAF8L1A6NGE4 600 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC15A5A6NIM6 579 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SOWAHDA6NJG2 315 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC169A6NNP5 214 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TISP43B9A030 160 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 K7ENM7 598 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 EPHB6O15197 1021 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARHGAP6O43182 974 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 STRNO43815 780 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 LGR5O75473 907 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 DGAT1O75907 488 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NOL4O94818 638 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 OATP04181 439 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TNNT1P13805 278 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARL2P36404 184 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NPTX2P47972 431 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 KCNJ6P48051 423 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NCKAP1LP55160 1127 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 KCNH2Q12809 1159 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MYBPC2Q14324 1141 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MTF1Q14872 753 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MTERF2Q49AM1 385 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 FIGNQ5HY92 759 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 RGMBQ6NW40 437 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 WDR59Q6PJI9 974 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NYAP1Q6ZVC0 841 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PLEKHH3Q7Z736 793 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SAPCD2Q86UD0 394 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CNGA4Q8IV77 575 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SYCP3Q8IZU3 236 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 RETREG2Q8NC44 543 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ASAP3Q8TDY4 903 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 AFAP1L1Q8TED9 768 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TMEM143Q96AN5 459 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC51Q96ER9 411 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 DRC1Q96MC2 740 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.3 ms