RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 POTEBQ6S5H4 581 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL29Q96CT2 875 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 LRGUKQ96M69 825 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 IQCB1Q15051 598 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 WRNIP1Q96S55 665 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ADCY2Q08462 1091 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF26B4DH59 902 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 FDX1P10109 184 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF18P17022 549 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 CA4P22748 312 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TFDP2Q14188 446 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SNCBQ16143 134 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF15Q8N660 670 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TTC36A6NLP5 189 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC53A6NM62 1247 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 GPC5P78333 572 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 NFU1Q9UMS0 254 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 OPHN1O60890 802 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 PALMO75781 387 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TNFAIP2Q03169 654 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 BANK1Q8NDB2 785 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 DONSONQ9NYP3 566 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 DYDC2Q96IM9 177 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA13P27216 316 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TTC13Q8NBP0 860 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 PHKA2P46019 1235 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 USP11P51784 963 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ARPP19P56211 112 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM260Q9NX78 707 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SPP2Q13103 211 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF394Q53GI3 561 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SCARF1Q14162 830 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 DENND3A2RUS2 1198 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SLC16A4O15374 487 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 GPSM2P81274 684 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ZWILCHQ9H900 591 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 CALB1P05937 261 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 CDO1Q16878 200 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 KRT37O76014 449 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 GNAT1P11488 350 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SP8Q8IXZ3 490 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 VPS39Q96JC1 886 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 POTEFA5A3E0 1075 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 POTEIP0CG38 1075 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 POTEGQ6S5H5 508 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF699Q32M78 642 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 KLC2Q9H0B6 622 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TOM1L1O75674 476 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ACSL3O95573 720 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 GINM1Q9NU53 330 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TTI1O43156 1089 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 EPHB1P54762 984 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf60Q5U649 245 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM270Q6UE05 265 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 VAMP7P51809 220 aa21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms