RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 RARRES1P49788 294 aa29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 FAM26DQ5JW98 314 aa29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 CLIC6Q96NY7 704 aa29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 CCSER1Q9C0I3 900 aa29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 SCN5AQ14524 2016 aa29.85■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 TANC1Q9C0D5 1861 aa29.84■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 M0QZ92 97 aa29.84■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 GAS2O43903 313 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 CUTAO60888 179 aa29.84■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 LINC01465Q8N7H1 131 aa29.84■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 MAP7D2Q96T17 732 aa29.84■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 A0A087WWV3 80 aa29.83■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 DGAT1O75907 488 aa29.83■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 CSF2RAP15509 400 aa29.83■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 TXLNAP40222 546 aa29.83■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 CDC42EP1Q00587 391 aa29.83■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 SCLYQ96I15 445 aa29.83■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 GDF15Q99988 308 aa29.83■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.83■■■□□ 2.37
CRIP1-201ENST00000330233 EYA4O95677 639 aa29.82■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 TRAF7Q6Q0C0 670 aa29.82■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC71Q8N4P6 559 aa29.82■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 EPSTI1Q96J88 318 aa29.82■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA32Q96LK8 384 aa29.82■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC39Q9UFE4 941 aa29.82■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF35A5YM69 484 aa29.81■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 ME1P48163 572 aa29.81■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 CLCN3P51790 818 aa29.81■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 GRB10Q13322 594 aa29.81■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 SPECC1Q5M775 1068 aa29.81■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.81■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 TCP11Q8WWU5 503 aa29.81■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 PNMA5Q96PV4 448 aa29.81■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 IL23AQ9NPF7 189 aa29.81■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 AKT3Q9Y243 479 aa29.81■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 CHRNA1P02708 482 aa29.8■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 PFKMP08237 780 aa29.8■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 BMP8BP34820 402 aa29.8■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM119Q4V9L6 283 aa29.8■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 MTRQ99707 1265 aa29.8■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 BHMT2Q9H2M3 363 aa29.8■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa29.8■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHA7Q9UN72 937 aa29.8■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 E9PMD0 336 aa29.79■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 CTSHP09668 335 aa29.79■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 MGAT3Q09327 533 aa29.79■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 EMC2Q15006 297 aa29.79■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 TET1Q8NFU7 2136 aa29.79■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 TRPV2Q9Y5S1 764 aa29.79■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 CDY2AQ9Y6F7 541 aa29.79■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 PADI6Q6TGC4 694 aa29.78■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 USP49Q70CQ1 688 aa29.78■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 PLIN2Q99541 437 aa29.78■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.78■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 SQORQ9Y6N5 450 aa29.78■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 ASAP2O43150 1006 aa29.77■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 VTNP04004 478 aa29.77■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM62Q0P6H9 643 aa29.77■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 KARSQ15046 597 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 DEFB128Q7Z7B8 93 aa29.77■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 MCPH1Q8NEM0 835 aa29.77■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 CXCL10P02778 98 aa29.76■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 KCNK18Q7Z418 384 aa29.76■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 USP38Q8NB14 1042 aa29.76■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
CRIP1-201ENST00000330233 USO1O60763 962 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 NBNO60934 754 aa29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 CYP11B2P19099 503 aa29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 PLCG1P19174 1290 aa29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 GPNMBQ14956 572 aa29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM143Q96AN5 459 aa29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 CHAMP1Q96JM3 812 aa29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 SIP14410 1827 aa29.75■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 GPR32O75388 356 aa29.74■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 FGBP02675 491 aa29.74■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 DRP2Q13474 957 aa29.74■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 MBTPS1Q14703 1052 aa29.74■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 RRAGBQ5VZM2 374 aa29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms