RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 BICD2Q8TD16 824 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 NID2Q14112 1375 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 HSPA4P34932 840 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM102BQ5T8I3 360 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM228AQ86W67 206 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC148Q8NFR7 591 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNB2Q92953 911 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 AAASQ9NRG9 546 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 RPS6KB1P23443 525 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 CLCN3P51790 818 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 AKT3Q9Y243 479 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 C9IYK1 514 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 THNSL1Q8IYQ7 743 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 EFHBQ8N7U6 833 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM167AQ96KS9 214 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 MAP7D2Q96T17 732 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 HCSTQ9UBK5 93 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR64B1ANS9 1081 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 GPR32O75388 356 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 FGFR1P11362 822 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 CIITAP33076 1130 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PPP4R4-202ENST00000328839 MAGEB2O15479 319 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 CHMP2AO43633 222 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 EFCAB12Q6NXP0 572 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC71Q8N4P6 559 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 LENG9Q96B70 501 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 MSLNLQ96KJ4 702 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 TLE6Q9H808 572 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 TLR9Q9NR96 1032 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM161AQ9NX61 479 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 CLEC1BQ9P126 229 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 FGF18O76093 207 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 PSMA5P28066 241 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 TMOD1P28289 359 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 NTRK3Q16288 839 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 DISC1Q9NRI5 854 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 MUTYHQ9UIF7 546 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 OATP04181 439 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 UBE3AQ05086 875 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 SCLT1Q96NL6 688 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 NRBP2Q9NSY0 501 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 PER2O15055 1255 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 MSH4O15457 936 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 GAS7O60861 476 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 GLP2RO95838 553 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 IFNAR1P17181 557 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 NLRP5P59047 1200 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 PRKCEQ02156 737 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXL16Q8N461 479 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF862O60290 1169 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 REC8O95072 547 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 EYA4O95677 639 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 LAG3P18627 525 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 COASYQ13057 564 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 DSC3Q14574 896 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 LRCH2Q5VUJ6 765 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 RNF135Q8IUD6 432 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 SMRP1Q8NCR6 262 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 TEKT3Q9BXF9 490 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 CWH43Q9H720 699 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM189BP81408 668 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 UGCGQ16739 394 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 ABI1Q8IZP0 508 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 RNF169Q8NCN4 708 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 GJA10Q969M2 543 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 ADAMTS10Q9H324 1103 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4R4-202ENST00000328839 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 USP11P51784 963 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 JAK3P52333 1124 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ERVFC1P60507 584 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 PLPP4Q5VZY2 271 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 LINC01465Q8N7H1 131 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 RIT2Q99578 217 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM117Q9H0C3 514 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 UNC45AQ9H3U1 944 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms