RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 CCL23P55773 120 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 SIP14410 1827 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CTSHP09668 335 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 TMOD1P28289 359 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 RFC5P40937 340 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 KCNK18Q7Z418 384 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 H0YGN5 161 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 PLCG1P19174 1290 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 SHC4Q6S5L8 630 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 BADQ92934 168 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 MYH11P35749 1972 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 EYA4O95677 639 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 SELPP16109 830 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 RBL2Q08999 1139 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 EMC2Q15006 297 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 SCLYQ96I15 445 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 MAP7D2Q96T17 732 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 PANK2Q9BZ23 570 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 AKT3Q9Y243 479 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 CAND2O75155 1236 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 DGAT1O75907 488 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 DNM2P50570 870 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 PADI6Q6TGC4 694 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 RPAINQ86UA6 219 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 MTRQ99707 1265 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 TET1Q8NFU7 2136 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 VTNP04004 478 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 IQCF3P0C7M6 154 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 RSPH10BP0C881 870 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 DRP2Q13474 957 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 MFSD5Q6N075 450 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 NME8Q8N427 588 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM199Q8N511 208 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 PDILTQ8N807 584 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 M0QZ92 97 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 IER5Q5VY09 327 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 ADALQ6DHV7 355 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM143Q96AN5 459 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 GINS2Q9Y248 185 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G4BP0C869 781 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 RESP18Q5W5W9 173 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC15Q8TF66 581 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 A0A087X0B3 334 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 CHRNA1P02708 482 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 CSF2RAP15509 400 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 STAT6P42226 847 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 TCP11Q8WWU5 503 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 RAD54LQ92698 747 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 FPGSQ05932 587 aa24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 FAM26DQ5JW98 314 aa24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 STK17AQ9UEE5 414 aa24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.83■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 CYP11B2P19099 503 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 SLC12A3P55017 1021 aa24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms