RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 GOLGA8HP0CJ92 632 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 GSTT1P30711 240 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 TRAPPC10P48553 1259 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 RCN1Q15293 331 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 CENPTQ96BT3 561 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 CYTH2Q99418 400 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ERP44Q9BS26 406 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 TAOK3Q9H2K8 898 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ARHGEF3Q9NR81 526 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 TTC36A6NLP5 189 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 KCNJ1P48048 391 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 CALCOCO2Q13137 446 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 DNAJC3Q13217 504 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF365Q70YC5 407 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 NT5C3AQ9H0P0 336 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 CYP39A1Q9NYL5 469 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 STX8Q9UNK0 236 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 LRRC37A3O60309 1634 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 MRC1P22897 1456 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 OPHN1O60890 802 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 SPAG7O75391 227 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ATF3P18847 181 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 OLFML2BQ68BL8 750 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 JAMLQ86YT9 394 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 FAM13CQ8NE31 585 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ACTRT1Q8TDG2 376 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 NDNQ99608 321 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 GALNT8Q9NY28 637 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10.99□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 USP17L12C9JPN9 530 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 USP17L21D6R901 530 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 LCA5LO95447 670 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 BAG2O95816 211 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 OR52Z1P0C646 297 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 SLC9A1P19634 815 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 NAPAP54920 295 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 EVA1CP58658 441 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 NPY5RQ15761 445 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 KIF6Q6ZMV9 814 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 EXOC3L1Q86VI1 746 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 NMRK1Q9NWW6 199 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 STOML1Q9UBI4 398 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ASIC3Q9UHC3 531 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 AKAP12Q02952 1782 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 WDR91A4D1P6 747 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 MYMKA6NI61 221 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ATP6V1G1O75348 118 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 GFPT2O94808 682 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 UNC5CO95185 931 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 PDE8BO95263 885 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 TPBGLP0DKB5 382 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ALADP13716 330 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 SLC5A1P13866 664 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 RASSF2P50749 326 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 EVX2Q03828 476 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ZBTB16Q05516 673 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ISLR2Q6UXK2 745 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 HS2ST1Q7LGA3 356 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 VPS52Q8N1B4 723 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 PHC3Q8NDX5 983 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 DCAF5Q96JK2 942 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 OCEL1Q9H607 264 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 JAG2Q9Y219 1238 aa10.98□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 DIP2AQ14689 1571 aa10.97□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 PEX11AO75192 247 aa10.97□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 CALM1P0DP23 149 aa10.97□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 CALM2P0DP24 149 aa10.97□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 CALM3P0DP25 149 aa10.97□□□□□ -0.65
CLDN1-201ENST00000295522 TROAPQ12815 778 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms