RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 OPTNQ96CV9 577 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 BORCS6Q96GS4 357 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 DMAC2Q9NW81 257 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC53A6NM62 1247 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 COPB2P35606 906 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 MYBPC2Q14324 1141 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 STXBP2Q15833 593 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 RRAGAQ7L523 313 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 GBP3Q9H0R5 595 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.61■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 UNCXA6NJT0 531 aa23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 CLIC2O15247 247 aa23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 LCA5LO95447 670 aa23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC9A9Q8IVB4 645 aa23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC42Q96M95 316 aa23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.6■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC25A27O95847 323 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 PLS3P13797 630 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 ICAM3P32942 547 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 CASP4P49662 377 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 MOGSQ13724 837 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 DRC1Q96MC2 740 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP7D2Q96T17 732 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 ABL1P00519 1130 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 TUBB2AQ13885 445 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC35C1Q96A29 364 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 GANQ9H2C0 597 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.59■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 CNMDO75829 334 aa23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 PSAPP07602 524 aa23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 OSBPP22059 807 aa23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM206Q9H813 350 aa23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25-201ENST00000293861 BACH1O14867 736 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 CNTN2Q02246 1040 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 POTEB2H3BUK9 544 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 K7ENM7 598 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 KSR1Q8IVT5 923 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC35F6Q8N357 371 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT86O43790 486 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 PEX10O60683 326 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 EDNRBP24530 442 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 XKR9Q5GH70 373 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 HGSNATQ68CP4 663 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 ANO5Q75V66 913 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA1328Q86T90 577 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 IKZF4Q9H2S9 585 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXL5Q9UKA1 691 aa23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 STBD1O95210 358 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF11P52732 1056 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 VAV2P52735 878 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 GTF2BQ00403 316 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SNAPC2Q13487 334 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SPA17Q15506 151 aa23.55■■□□□ 1.36
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