RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 HBP1O60381 514 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 KLRC1P26715 233 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 LRRC55Q6ZSA7 311 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 OTOP3Q7RTS5 596 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 TMEM40Q8WWA1 233 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CASD1Q96PB1 797 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SDF4Q9BRK5 362 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 DLL3Q9NYJ7 618 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SPDYE3A6NKU9 549 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ACTR2P61160 394 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 DSC3Q14574 896 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 WTAPQ15007 396 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SART3Q15020 963 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CATIPQ7Z7H3 387 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SLC39A11Q8N1S5 342 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 MAP3K14Q99558 947 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 IRAK3Q9Y616 596 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.9□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ATG7O95352 703 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CXCL14O95715 111 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 WEE2P0C1S8 567 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CA8P35219 290 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 FAM228AQ86W67 206 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 PPFIBP1Q86W92 1011 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 SIX5Q8N196 739 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 RUBCNQ92622 972 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 TMEM169Q96HH4 297 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 LZTS2Q9BRK4 669 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 KCNH7Q9NS40 1196 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 WNT16Q9UBV4 365 aa11.89□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CEP250Q9BV73 2442 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 TPRP12270 2363 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 KRT37O76014 449 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 SDHBP21912 280 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 KIF5BP33176 963 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 PBX3P40426 434 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 GPR149Q86SP6 731 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CABP7Q86V35 215 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 BORCS6Q96GS4 357 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 OSMRQ99650 979 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 HINFPQ9BQA5 517 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 MXRA8Q9BRK3 442 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 KCNK12Q9HB15 430 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 RNF19AQ9NV58 838 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 EPG5Q9HCE0 2579 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 WDR81Q562E7 1941 aa11.88□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 STK25O00506 426 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 RFX1P22670 979 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 GNAQP50148 359 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 KIZQ2M2Z5 673 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 TEX2Q8IWB9 1127 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 VPS52Q8N1B4 723 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ZBP1Q9H171 429 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 OSBPL3Q9H4L5 887 aa11.87□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 BACH1O14867 736 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 GPR32O75388 356 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 DDAH1O94760 285 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms