RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289577.9

TMED4-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMED4, Length 2,203 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4-201ENST00000289577 USP17L19D6RCP7 530 aa22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 USP17L20D6RJB6 530 aa22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 PPARDQ03181 441 aa22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 USP17L24Q0WX57 530 aa22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 FUKQ8N0W3 1084 aa22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 RAB17Q9H0T7 212 aa22.14■■□□□ 1.14
TMED4-201ENST00000289577 GNPATO15228 680 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 FGGP02679 453 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CASP4P49662 377 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CDR1P51861 262 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PPATQ06203 517 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 GJB7Q6PEY0 223 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 BORCS6Q96GS4 357 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 FMO2Q99518 471 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 DNM3Q9UQ16 869 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 NR2E1Q9Y466 385 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 GHRP10912 638 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 RPA1P27694 616 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 STAT1P42224 750 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 SCTRP47872 440 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PPP2R5EQ16537 467 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 DUPD1Q68J44 220 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CCT6BQ92526 530 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ANO3Q9BYT9 981 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 F8W031 263 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 BACH1O14867 736 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 UFL1O94874 794 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 NUDT17P0C025 328 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 TMEM253P0C7T8 217 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ATP2B4P23634 1241 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 WLSQ5T9L3 541 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 RFFLQ8WZ73 363 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 SGSM3Q96HU1 749 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 EVI5O60447 810 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CCDC172P0C7W6 258 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 XRCC4Q13426 336 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ERMNQ8TAM6 284 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 SYT11Q9BT88 431 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 LMNB1P20700 586 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PLS1Q14651 629 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 KCTD1Q719H9 257 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 HOOK3Q86VS8 718 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ERP44Q9BS26 406 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CARD9Q9H257 536 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 MEIS1O00470 390 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 TBX3O15119 743 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CAND2O75155 1236 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 SOX5P35711 763 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 SNCBQ16143 134 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 MCM8Q9UJA3 840 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 FAM187AA6NFU0 413 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PICALMQ13492 652 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 MDM1Q8TC05 714 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 SHMT1P34896 483 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 DR1Q01658 176 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 KLRC3Q07444 240 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms