RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 POTEGQ6S5H5 508 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 ERMNQ8TAM6 284 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 USP28Q96RU2 1077 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 PBX4Q9BYU1 374 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 PTPRSQ13332 1948 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 F13A1P00488 732 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 PFKMP08237 780 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 RPA1P27694 616 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 CDC25AP30304 524 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 PBX2P40425 430 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 DRP2Q13474 957 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 ECM1Q16610 540 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 CEP170P1Q96L14 293 aa23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 BMP15O95972 392 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 VTNP04004 478 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 GRIN1Q05586 938 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 XKR9Q5GH70 373 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 RAB34Q9BZG1 259 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 MSRAQ9UJ68 235 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.51■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 RAB30Q15771 203 aa23.5■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.5■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 NME8Q8N427 588 aa23.5■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.5■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.5■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.5■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 GHRP10912 638 aa23.49■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 LPIN1Q14693 890 aa23.49■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.49■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 IER5Q5VY09 327 aa23.49■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.49■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 GBF1Q92538 1859 aa23.49■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 RARRES1P49788 294 aa23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 MAP7D2Q96T17 732 aa23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 AKT3Q9Y243 479 aa23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 PPME1Q9Y570 386 aa23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.48■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 M0QZ92 97 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 GPR32O75388 356 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 BRD1O95696 1058 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 TMOD1P28289 359 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 RFC5P40937 340 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 EMC2Q15006 297 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 KIZQ2M2Z5 673 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 KRT79Q5XKE5 535 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 GINS2Q9Y248 185 aa23.47■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 ACTN1P12814 892 aa23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.352e-8■□□□□ 9.4
COX5B-201ENST00000258424 MUTP22033 750 aa23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 NACC1Q96RE7 527 aa23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 OSMRQ99650 979 aa23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 STK24Q9Y6E0 443 aa23.46■■□□□ 1.35
COX5B-201ENST00000258424 ZBBXA8MT70 800 aa23.45■■□□□ 1.34
COX5B-201ENST00000258424 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
COX5B-201ENST00000258424 SLC39A14Q15043 492 aa23.45■■□□□ 1.34
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