RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.5■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 NEK9Q8TD19 979 aa24.5■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 MBOAT7Q96N66 472 aa24.5■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.5■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.5■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 GRXCR2A6NFK2 248 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 H3BQ06 376 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 MAGEB2O15479 319 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 SLC37A4O43826 429 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 TMOD1P28289 359 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 FOSBP53539 338 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 C8orf34Q49A92 452 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 TCEAL5Q5H9L2 206 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 BANK1Q8NDB2 785 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 MAP7D2Q96T17 732 aa24.49■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 JAK2O60674 1132 aa24.48■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.48■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 C5orf42Q9H799 3197 aa24.48■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 PADI3Q9ULW8 664 aa24.48■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 AKT3Q9Y243 479 aa24.48■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.48■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 ENPP3O14638 875 aa24.47■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 ZNF862O60290 1169 aa24.47■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 NR5A1Q13285 461 aa24.47■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 COL19A1Q14993 1142 aa24.47■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 UGCGQ16739 394 aa24.47■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 KIZQ2M2Z5 673 aa24.47■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 ODR4Q5SWX8 454 aa24.47■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 FAM20AQ96MK3 541 aa24.47■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 RPS6KA5O75582 802 aa24.46■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 CLCN3P51790 818 aa24.46■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.46■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.46■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 PIEZO1Q92508 2521 aa24.46■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 TTC3P53804 2025 aa24.45■■□□□ 1.51
NME4-201ENST00000219479 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 MMP1P03956 469 aa24.45■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 VTNP04004 478 aa24.45■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.45■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 XKR3Q5GH77 459 aa24.45■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.45■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 FIBCD1Q8N539 461 aa24.45■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 SCLT1Q96NL6 688 aa24.45■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.45■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 TBX3O15119 743 aa24.44■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 LINC00271P0C7V0 271 aa24.44■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.44■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 OSMRQ99650 979 aa24.44■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 KIAA1671Q9BY89 1806 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 TRIOO75962 3097 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 DENND3A2RUS2 1198 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 PRR33A8MZF0 331 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 GPR182O15218 404 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 STAG3L1P0CL83 205 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 CTNNB1P35222 781 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 PSMC5P62195 406 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 PPP2R5CQ13362 524 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 MTERF2Q49AM1 385 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 EP400NLQ6ZTU2 488 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 POTEDQ86YR6 584 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa24.43■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 FAM205CA6NFA0 338 aa24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 BTBD18B2RXH4 712 aa24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 C5orf67F2Z3F1 127 aa24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 CLDND1Q9NY35 253 aa24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 VAV3Q9UKW4 847 aa24.42■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.41■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 ALADP13716 330 aa24.41■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 DNM2P50570 870 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms