RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PSME4Q14997 1843 aa24.08■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CLSTN1O94985 981 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GJB7Q6PEY0 223 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KRT12Q99456 494 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EPB41L5Q9HCM4 733 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DMAC2Q9NW81 257 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GOLGA8KD6RF30 607 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 OPA1O60313 960 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GFPT2O94808 682 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.449e-54■■■■□ 20.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 H2AFZP0C0S5 128 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 STAT1P42224 750 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UBXN2AP68543 259 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GUCY2DQ02846 1103 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PAK2Q13177 524 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 H2AFVQ71UI9 128 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 VCPKMTQ9H867 229 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CLRN2A0PK11 232 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KCNK3O14649 394 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARP10275 920 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FMO5P49326 533 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TNNC1P63316 161 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM160B2Q86V87 743 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HSF2BPO75031 334 aa24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPFIA1Q13136 1202 aa24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 COG2Q14746 738 aa24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NFU1Q9UMS0 254 aa24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 STK33Q9BYT3 514 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CNTNAP1P78357 1384 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GUCY2CP25092 1073 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SOX5P35711 763 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NPEPPSP55786 919 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KSR1Q8IVT5 923 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MREGQ8N565 214 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SCFD2Q8WU76 684 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYH11P35749 1972 aa24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EVI5O60447 810 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPP2R5AQ15172 486 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DLGAP5Q15398 846 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ODR4Q5SWX8 454 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ESYT3A0FGR9 886 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 F8VZ95 297 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LDHDQ86WU2 507 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IFT81Q8WYA0 676 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GMLQ99445 158 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RIT2Q99578 217 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 STRA6Q9BX79 667 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FEM1BQ9UK73 627 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RAD51CO43502 376 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TBC1D12O60347 775 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM153BP0C7A2 387 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM153CQ494X1 144 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IQCKQ8N0W5 287 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RUFY1Q96T51 708 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LXNQ9BS40 222 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms