RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212355.8

TGFBR3-201, Transcript of transforming growth factor beta receptor 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TGFBR3, Length 6,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3-201ENST00000212355 CYP4F11Q9HBI6 524 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 WDR64B1ANS9 1081 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 TMPRSS15P98073 1019 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.6□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.6□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 HADHAP40939 763 aa14.6□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.6□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 A0A0G2JLW4 131 aa14.6□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 RASA4O43374 803 aa14.6□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 TRIM49CP0CI26 452 aa14.6□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.6□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 TDP2O95551 362 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 NUP85Q9BW27 656 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 VPS11Q9H270 941 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 K7ERI5 159 aa14.6□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 SCARF1Q14162 830 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 METTL23Q86XA0 190 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 CEP95Q96GE4 821 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 NBPF3Q9H094 633 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 CUEDC2Q9H467 287 aa14.6□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 PMLP29590 882 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 EPHB1P54762 984 aa14.59□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.59□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 TMEM206Q9H813 350 aa14.59□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.59□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.59□□□□□ -0.07
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TGFBR3-201ENST00000212355 KCNH2Q12809 1159 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 EVI5O60447 810 aa14.58□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 POU5F1BQ06416 359 aa14.58□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.58□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 TMEM94Q12767 1356 aa14.58□□□□□ -0.08
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TGFBR3-201ENST00000212355 FBXO41Q8TF61 875 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 STK17AQ9UEE5 414 aa14.58□□□□□ -0.08
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TGFBR3-201ENST00000212355 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.58□□□□□ -0.08
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TGFBR3-201ENST00000212355 AP1B1Q10567 949 aa14.58□□□□□ -0.08
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TGFBR3-201ENST00000212355 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 NCLNQ969V3 563 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 MXD3Q9BW11 206 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 HPS4Q9NQG7 708 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 H0YCG3 227 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 PTPREP23469 700 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBR3-201ENST00000212355 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.58□□□□□ -0.08
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