RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000056233.3

NFE2L3-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L3, Length 3,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3-201ENST00000056233 LRRC37A3O60309 1634 aa18.28■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 CCT8L1PA6NM43 557 aa18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 HIP1RO75146 1068 aa18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 SUN1O94901 812 aa18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 CPP00450 1065 aa18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 PRLRP16471 622 aa18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 FECHP22830 423 aa18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 NMT1P30419 496 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 NFAT5O94916 1531 aa18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 IFNB1P01574 187 aa18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 GRIK5Q16478 980 aa18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
NFE2L3-201ENST00000056233 TMED2Q15363 201 aa18.27■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 KAZNQ674X7 775 aa18.27■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 NR2E1Q9Y466 385 aa18.27■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC188H7C350 402 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 NR3C1P04150 777 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 RASA1P20936 1047 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 RFC4P35249 363 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 ETNK1Q9HBU6 452 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 ABCF3Q9NUQ8 709 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 GOLGA8IPA6NC78 632 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 GOLGA8JA6NMD2 632 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 TOM1O60784 492 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 SPAG7O75391 227 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 UBOX5O94941 541 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 KCNA1Q09470 495 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 TPCN2Q8NHX9 752 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 ANP32DO95626 131 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 CHADLQ6NUI6 762 aa18.26■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 CLGNO14967 610 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 DLATP10515 647 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 CTNNA2P26232 953 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 PRPHP41219 470 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 BIRC2Q13490 618 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 FIGNQ5HY92 759 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF365Q70YC5 407 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 TRIM33Q9UPN9 1127 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 CASP5P51878 434 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 C2CD6Q53TS8 623 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM178BQ8IXR5 827 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 TRIM7Q9C029 511 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 TRAPPC3O43617 180 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 AKR1B1P15121 316 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 PSMC6P62333 389 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 ODR4Q5SWX8 454 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 BCAS3Q9H6U6 928 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.25■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 MYH6P13533 1939 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 ECM1Q16610 540 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 HGSNATQ68CP4 663 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 VPS37BQ9H9H4 285 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 SORBS3O60504 671 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 NTSR2O95665 410 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 KCNJ2P63252 427 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF384Q8TF68 577 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 F8VZ95 297 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC174Q6PII3 467 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 JAMLQ86YT9 394 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 KIAA0825Q8IV33 1275 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 THAP2Q9H0W7 228 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 DONSONQ9NYP3 566 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 HLA-DOAP06340 250 aa18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 BRAFP15056 766 aa18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 FERP16591 822 aa18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 GCLMP48507 274 aa18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 CDK17Q00537 523 aa18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 DOK7Q18PE1 504 aa18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 TMC3Q7Z5M5 1100 aa18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 SCFD1Q8WVM8 642 aa18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 C9orf72Q96LT7 481 aa18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC77Q9BR77 488 aa18.23■□□□□ 0.51
NFE2L3-201ENST00000056233 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms