RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zscan4cQ80VJ6 506 aa12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmem220Q8BP07 167 aa12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Metap1Q8BP48 386 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cep55Q8BT07 462 aa12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plekhs1Q8BW88 474 aa12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 DymQ8CHY3 669 aa12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kbtbd4Q8R179 534 aa12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Git2Q9JLQ2 708 aa12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Clcn5Q9WVD4 746 aa12.4□□□□□ -0.42
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gvin1Q80SU7 2427 aa12.4□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm38392E9Q2A2 434 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm6583E9Q8Z1 469 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 SprtnG3X912 497 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fdxacb1Q3UY23 622 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf652Q5DU09 608 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 P2ry10Q8BFU7 328 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nipa1Q8BHK1 323 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc15a5Q8CBB2 566 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pak2Q8CIN4 524 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Acvr1cQ8K348 493 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Polr3eQ9CZT4 710 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Noxred1Q9D3S5 366 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc105Q9D4K7 499 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cd97Q9Z0M6 818 aa12.39□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pex10B1AUE5 324 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Bcl7cO08664 217 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 MafgO54790 162 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Apba3O88888 571 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lrrc4bP0C192 709 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Adssl1P28650 457 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mark2Q05512 776 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm14851Q5ERJ0 116 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyth4Q80YW0 393 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prss50Q8BLH5 439 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Vopp1Q8R1C3 172 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mob2Q8VI63 235 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tube1Q9D6T1 475 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kcnq4Q9JK97 696 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Akt3Q9WUA6 479 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Scn5aQ9JJV9 2019 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 KcpQ3U492 1550 aa12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm11985A0A1B0GS61 206 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc16a6B1AT66 607 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam170bE9PXT9 378 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Svs3aF2Z472 265 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Psmc3O88685 442 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccr5P51682 354 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 MafbP54841 323 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rin3P59729 980 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Erbb2P70424 1256 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Col9a2Q07643 688 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gse1Q3U3C9 1213 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 MycbpapQ5SUV2 932 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trpc6Q61143 930 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ifit2Q64112 472 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 OcrlQ6NVF0 900 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr538Q7TRT5 310 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lats2Q7TSJ6 1042 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Phldb2Q8K1N2 1249 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Bbox1Q924Y0 387 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 TbcbQ9D1E6 244 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Syde1Q9DBZ9 737 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mlh1Q9JK91 760 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arih2Q9Z1K6 492 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 SpegQ62407 3262 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tp53bp1P70399 1969 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zfp40B1B1D3 796 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tgfbr3lD3YZZ2 297 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gprin2D3Z1D7 455 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lmod3E9QA62 571 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmod1P49813 359 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sash1P59808 1230 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Perm1Q149B8 807 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ntan1Q64311 310 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prmt8Q6PAK3 394 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 NeproQ8R2U2 564 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc71Q8VEG0 433 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ephx1Q9D379 455 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Extl2Q9ES89 330 aa12.37□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa12.36□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa12.36□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dlg3P70175 849 aa12.36□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf827Q505G8 1078 aa12.36□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa12.36□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa12.36□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CnstQ8CBC4 711 aa12.36□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tesk2Q8VCT9 570 aa12.36□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Atp6v0a4Q920R6 833 aa12.36□□□□□ -0.43
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tas1r3Q925D8 858 aa12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms