RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	ELF2	Q15723	593 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC93	Q567U6	631 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	DTX1	Q86Y01	620 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CNPY4	Q8N129	248 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	RSAD1	Q9HA92	442 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	VAV3	Q9UKW4	847 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PIK3C2B	O00750	1634 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TNR	Q92752	1358 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BS24	57 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TPP1	O14773	563 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SHOX	O15266	292 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOBTB3	O94955	611 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	AGR2	O95994	175 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SOD2	P04179	222 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPA6	P17066	643 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	GFRA1	P56159	465 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKCQ	Q04759	706 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	FAP	Q12884	760 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MISP3	Q96FF7	219 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TONSL	Q96HA7	1378 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SHISA3	A0PJX4	238 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAF5	O00463	557 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	AP1G1	O43747	822 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ULK1	O75385	1050 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CFB	P00751	764 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PRNP	P04156	253 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MYB	P10242	640 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TM4SF4	P48230	202 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP4K2	Q12851	820 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	AOC3	Q16853	763 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2F	Q969M7	185 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf159	Q96HA4	380 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SGCZ	Q96LD1	299 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MKS1	Q9NXB0	559 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		5.97	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SYNM	O15061	1565 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	WASH4P	A8MWX3	477 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	VCAM1	P19320	739 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CD247	P20963	164 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFAIP3	P21580	790 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	BNIP3	Q12983	259 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM14	Q14142	442 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	DACT2	Q5SW24	774 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MZT2A	Q6P582	158 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	BRF1	Q92994	677 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ERP27	Q96DN0	273 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	GBP3	Q9H0R5	595 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		5.96	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	POLG2	Q9UHN1	485 aa		5.96	□□□□□ -1.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms