RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626735.2

PCBP1-AS1-300, PCBP1 antisense RNA 1, human

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 717 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	LINC01565	O15544	149 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CDC45	O75419	566 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ITGB1	P05556	798 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	STAG3L1	P0CL83	205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	GATM	P50440	423 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	PKN1	Q16512	942 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	BACH1	O14867	736 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	MBTPS2	O43462	519 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	DCX	O43602	365 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	C22orf31	O95567	290 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ALAD	P13716	330 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CPA1	P15085	419 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ZNF76	P36508	570 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	APOBR	Q0VD83	1088 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ADAM15	Q13444	863 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CLUL1	Q15846	466 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ZNF302	Q9NR11	478 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735		C9IYK1	514 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	RPS6KA5	O75582	802 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CSPG5	O95196	566 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	GLP2R	O95838	553 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	IRS1	P35568	1242 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	MCTP2	Q6DN12	878 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	LENG9	Q96B70	501 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	RGS18	Q9NS28	235 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	TECTA	O75443	2155 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	EDIL3	O43854	480 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	GPR32	O75388	356 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	EYA4	O95677	639 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CIITA	P33076	1130 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	DSC3	Q14574	896 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	NTRK3	Q16288	839 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735		Q6ZUG5	572 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	FAM228A	Q86W67	206 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	EFHB	Q8N7U6	833 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	BRF1	Q92994	677 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	UIMC1	Q96RL1	719 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	OSMR	Q99650	979 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ADAM2	Q99965	735 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	IGFLR1	Q9H665	355 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CLEC1B	Q9P126	229 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	CD207	Q9UJ71	328 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	GINS2	Q9Y248	185 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-300	ENST00000626735	DENND3	A2RUS2	1198 aa		11.58	□□□□□ -0.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms