RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620507.4

RBFOX1-223, Transcript of RNA binding fox-1 homolog 1, human

TSL 5 BASIC

Gene RBFOX1, Length 4,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBFOX1-223	ENST00000620507	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
RBFOX1-223	ENST00000620507	NFU1	Q9UMS0	254 aa		10.02	□□□□□ -0.8
RBFOX1-223	ENST00000620507	MYZAP	P0CAP1	466 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	GIT2	Q14161	759 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	DACT2	Q5SW24	774 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	KCTD16	Q68DU8	428 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	MYH6	P13533	1939 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	SASH3	O75995	380 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	RSPH10B	P0C881	870 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	KLRC1	P26715	233 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CYP2C19	P33261	490 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	GGCX	P38435	758 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	MTMR1	Q13613	665 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	EPHA7	Q15375	998 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	WDR93	Q6P2C0	686 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	MS4A14	Q96JA4	679 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	PNMA2	Q9UL42	364 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507		A0A087X0T9	212 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	FAM228B	P0C875	321 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	TRIM49	P0CI25	452 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	TRIM49C	P0CI26	452 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	STRN3	Q13033	797 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	MKL1	Q969V6	931 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	RAB17	Q9H0T7	212 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	DPH5	Q9H2P9	285 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	VCPKMT	Q9H867	229 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CASZ1	Q86V15	1759 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	SMIM23	A6NLE4	172 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	FAM86B1	E9PN63	330 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	ATP1A2	P50993	1020 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	GNGT1	P63211	74 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	PTK2	Q05397	1052 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CALCOCO2	Q13137	446 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	PPP1R7	Q15435	360 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CLUL1	Q15846	466 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CCDC25	Q86WR0	208 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	EPHB6	O15197	1021 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	GJC1	P36383	396 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	MXI1	P50539	228 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	PEX3	P56589	373 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	PPARD	Q03181	441 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	PRKG1	Q13976	671 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	PPP2R5E	Q16537	467 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507		Q4G0T1	1027 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	SORBS3	O60504	671 aa		10	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	TNNI1	P19237	187 aa		10	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	BAG6	P46379	1132 aa		10	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	MTMR3	Q13615	1198 aa		10	□□□□□ -0.81
RBFOX1-223	ENST00000620507	ALS2CL	Q60I27	953 aa		10	□□□□□ -0.81

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