RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576		H3BRB1	525 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC26A2	P50443	739 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLCB4	Q15147	1175 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP170P1	Q96L14	293 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	BIN1	O00499	593 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAMTS4	O75173	837 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASIC1	P78348	528 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA20	Q8TB22	786 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLD4	Q9HCU8	107 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYL1	P05976	194 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTFR1	Q15390	333 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTERF2	Q49AM1	385 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ISM2	Q6H9L7	571 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM167A	Q96KS9	214 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MSC	O60682	206 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMC2	O95347	1197 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	F2	P00734	622 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYL3	P08590	195 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHMP4BP1	P59074	171 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	LHX8	Q68G74	356 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KAT2B	Q92831	832 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	IDE	P14735	1019 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	REEP2	Q9BRK0	252 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLRC4	O43908	158 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	NKX3-2	P78367	333 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	GIT2	Q14161	759 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCND2	Q9NZV8	630 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	HBP1	O60381	514 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RSPH10B	P0C881	870 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP89	Q96ST8	783 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	INSRR	P14616	1297 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	GUCY2C	P25092	1073 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNA10	Q16322	511 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF208	Q9H0X6	261 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SFI1	A8K8P3	1242 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DGAT1	O75907	488 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	BMP6	P22004	513 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SOX10	P56693	466 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	UNC13D	Q70J99	1090 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF180	Q86T96	592 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEFB118	Q96PH6	123 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASGR1	P07306	291 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCL5	P13501	91 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGBP1	P78318	339 aa		10.16	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms